Когда мы выбирали тему проекта, то мы не могли пройти мимо проблемы пандемии и COVID-19. В разгаре карантина вышло несколько пресс-релизов и статей о том, что генетические варианты коронавируса могут влиять на способ лечения пациентов [1, 2, 3]. Поэтому мы решили сделать такой детектор на варианты SARS-CoV-2.
Однако, консультации с врачами и вирусологами дали нам понять, что однозначной связи между генетическими вариантами коронавируса и симптоматикой/способом лечения нету. Может быть эта связь будет установлена в дальнейших исследованиях, и наш детектор может пригодиться и для этого вируса, но пока… Пока мы хотим сделать то, что уже сейчас поможет людям!
Поэтому мы остановились на другом РНК-содержащем вирусе - вирусе гепатита С. Вирус гепатита С вызывает одноименное заболевание, которое может привести к циррозу и раку печени. Существует несколько генетических вариантов вируса гепатита С, в том числе рекомбинантный штамм, особенно распространенный в России. От этого заболевания нет вакцины, а терапия и эффективность лечения зависит от генетического варианта вируса.
Поговорив с экспертами мы выяснили, что тест на генотипирование не покрывается полисом ОМС, пациенты вынуждены платить сами. При этом тест могут позволить себе далеко не все пациенты и значительная часть людей не узнает свой генетический вариант вируса гепатита С. Также тестирование идет медленно, и может пройти значительное время между сдачей анализов и получением результатов. В конце концов, Никита Коваленко, председатель правления МОО “Вместе против гепатита” рассказал, что далеко не все регионы России достаточно оснащены, чтобы проводить тесты и определять генетические варианты.
Сейчас мы работаем над детекцией различных генетических вариантов вируса гепатита С. Мы создаем быстрый и портативный детектор на генетические варианты вируса, разговариваем со специалистами из лабораторий, исследующих генотипы вирусов, с компаниями, создающими вакцины, чтобы сделать детектор удобным для пользователей.
Экспертные мнения специалистов по поводу детекции вируса гепатита С и коронавируса прикрепляем к посту.
_ _ _ _
1) Xiaolu Tang et al./ On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2/National Science Review, V. 7, Issue 6, June 2020, Pages 1012–1023, https://doi.org/10.1093/nsr/nwaa036
2) Korber et al./ Spike mutation pipeline reveals the emergence of a more transmissible form of SARS-CoV-2/bioRxiv, May 2020, https://doi.org/10.1101/2020.04.29.069054
3) Kai-Wang To et al./ COVID-19 re-infection by a phylogenetically distinct SARS-coronavirus-2 strain confirmed by whole genome sequencing/ Clin Infect Dis, 2020 Aug 25;ciaa1275. doi: 10.1093/cid/ciaa1275
-
- Андрей Буйневич
- Автор проекта